Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms