Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTAP09496 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTAP09496 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTAP09496 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTAP09496 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTAP09496 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTAP09496 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTAP09496 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTAP09496 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTAP09496 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTAP09496 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTAP09496 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTAP09496 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTAP09496 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTAP09496 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTAP09496 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTAP09496 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTAP09496 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTAP09496 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTAP09496 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTAP09496 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTAP09496 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTAP09496 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTAP09496 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTAP09496 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTAP09496 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTAP09496 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTAP09496 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTAP09496 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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