Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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ZBED1O96006 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ZBED1O96006 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZBED1O96006 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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