Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms