Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms