Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HECW1Q76N89 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms