Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXO38Q6PIJ6 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXO38Q6PIJ6 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXO38Q6PIJ6 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FBXO38Q6PIJ6 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
FBXO38Q6PIJ6 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FBXO38Q6PIJ6 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
FBXO38Q6PIJ6 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FBXO38Q6PIJ6 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FBXO38Q6PIJ6 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FBXO38Q6PIJ6 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FBXO38Q6PIJ6 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FBXO38Q6PIJ6 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FBXO38Q6PIJ6 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 DNAH2-202ENST00000570791 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 DYRK4-214ENST00000543431 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 FAM198B-207ENST00000592057 3425 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXO38Q6PIJ6 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms