Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PKDCCQ504Y2 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms