Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTXN3Q4LDR2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTXN3Q4LDR2 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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