Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 ZNF93-205ENST00000591366 590 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 DNASE1L1-205ENST00000369809 3008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NBR1Q14596 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 RIPK4-202ENST00000352483 4016 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 CDCA2-202ENST00000380665 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 TMCC2-208ENST00000545499 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NBR1Q14596 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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