Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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