Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CUL4BQ13620 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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