Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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FOXF1Q12946 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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FOXF1Q12946 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FOXF1Q12946 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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FOXF1Q12946 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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FOXF1Q12946 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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FOXF1Q12946 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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