Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2C1P98194 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms