Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
FAM3AP98173 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms