Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AC008609.1-202ENST00000501818 2686 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 TK2-206ENST00000527800 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CBLB-203ENST00000403724 3350 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 ZNF542P-207ENST00000495307 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 RPS6KA1-220ENST00000531382 2359 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 HIST1H2BH-201ENST00000619466 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 PMS2-201ENST00000265849 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CYP4F3-206ENST00000591058 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX1P83916 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 COL12A1-202ENST00000345356 5886 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AC026469.1-201ENST00000621095 3306 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 PROS1-202ENST00000394236 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 ST6GAL1-215ENST00000457772 3947 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 LILRB1-208ENST00000427581 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 BDNF-218ENST00000533246 4000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 PIP5K1A-203ENST00000368890 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 ZSCAN21-205ENST00000543588 1870 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 MYBPC3-204ENST00000545968 4226 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 RNF10-201ENST00000325954 3825 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 RNF13-203ENST00000392894 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 ATP6AP1-210ENST00000619046 2823 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 DUSP16-201ENST00000228862 3402 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AC068896.1-201ENST00000494792 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX1P83916 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 SLC22A12-204ENST00000377574 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 EMB-201ENST00000303221 4281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 IVD-203ENST00000479013 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 EFL1-201ENST00000268206 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 COL22A1-203ENST00000435777 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CDRT4-204ENST00000619038 2498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 RPS10P7-201ENST00000441932 2329 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CBX1P83916 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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