Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms