Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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MMP13P45452 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP13P45452 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP13P45452 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MMP13P45452 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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MMP13P45452 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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MMP13P45452 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP13P45452 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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MMP13P45452 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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MMP13P45452 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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MMP13P45452 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP13P45452 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP13P45452 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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MMP13P45452 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP13P45452 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP13P45452 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP13P45452 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP13P45452 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP13P45452 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP13P45452 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP13P45452 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP13P45452 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MMP13P45452 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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MMP13P45452 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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MMP13P45452 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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MMP13P45452 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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MMP13P45452 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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MMP13P45452 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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MMP13P45452 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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MMP13P45452 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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MMP13P45452 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MMP13P45452 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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