Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GGCXP38435 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GGCXP38435 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GGCXP38435 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GGCXP38435 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GGCXP38435 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GGCXP38435 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GGCXP38435 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GGCXP38435 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GGCXP38435 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms