Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ARL3P36405 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ARL3P36405 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ARL3P36405 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ARL3P36405 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ARL3P36405 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ARL3P36405 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ARL3P36405 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ARL3P36405 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ARL3P36405 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ARL3P36405 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ARL3P36405 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ARL3P36405 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ARL3P36405 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ARL3P36405 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ARL3P36405 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ARL3P36405 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ARL3P36405 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ARL3P36405 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ARL3P36405 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ARL3P36405 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ARL3P36405 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ARL3P36405 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 DZIP1-201ENST00000347108 7068 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 ZZEF1-201ENST00000381638 11456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 RBM20-201ENST00000369519 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 XIRP1-202ENST00000396251 6040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 UGGT2-203ENST00000376747 4832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL3P36405 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL3P36405 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL3P36405 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL3P36405 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL3P36405 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL3P36405 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL3P36405 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL3P36405 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL3P36405 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL3P36405 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL3P36405 ZNF142-201ENST00000411696 5926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms