Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GBP2P32456 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms