Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP1P29466 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP1P29466 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP1P29466 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP1P29466 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP1P29466 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP1P29466 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP1P29466 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP1P29466 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP1P29466 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP1P29466 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP1P29466 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP1P29466 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP1P29466 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CASP1P29466 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CASP1P29466 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms