Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SDSP20132 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDSP20132 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SDSP20132 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDSP20132 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDSP20132 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDSP20132 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SDSP20132 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDSP20132 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SDSP20132 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDSP20132 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDSP20132 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDSP20132 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDSP20132 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDSP20132 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDSP20132 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDSP20132 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDSP20132 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDSP20132 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDSP20132 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDSP20132 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDSP20132 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDSP20132 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SDSP20132 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SDSP20132 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDSP20132 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SDSP20132 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
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