Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GLI3P10071 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GLI3P10071 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GLI3P10071 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GLI3P10071 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GLI3P10071 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GLI3P10071 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 ZNF793-205ENST00000587143 1488 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 MRPL19-203ENST00000409374 1076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 AKR1C6P-201ENST00000432950 983 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 AC116347.1-201ENST00000442824 720 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 CFL1P1-204ENST00000456375 424 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 SMUG1-213ENST00000506595 712 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 RN7SL5P-201ENST00000581458 321 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 AC022167.5-201ENST00000636296 1250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 BIN3-212ENST00000640731 450 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 USP8-219ENST00000625664 1568 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GLI3P10071 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GLI3P10071 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GLI3P10071 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GLI3P10071 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GLI3P10071 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GLI3P10071 PGAM1P10-201ENST00000402426 761 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GLI3P10071 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GLI3P10071 MRPS16P3-201ENST00000415961 374 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GLI3P10071 AC159540.1-201ENST00000422600 555 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GLI3P10071 AL110503.1-201ENST00000457224 534 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GLI3P10071 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GLI3P10071 CYP4F10P-201ENST00000589560 752 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GLI3P10071 CALM3-206ENST00000594523 540 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GLI3P10071 AL033381.2-201ENST00000603854 732 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GLI3P10071 AL161937.2-201ENST00000615503 403 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GLI3P10071 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GLI3P10071 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GLI3P10071 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GLI3P10071 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GLI3P10071 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AL139424.2-202ENST00000641335 1369 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 SPINK2-201ENST00000248701 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 IGHV1OR15-9-201ENST00000338912 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 UGT1A6-202ENST00000373424 1128 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 HLA-DQB3-203ENST00000425319 356 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 LINC01508-201ENST00000425666 1013 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AL357558.2-201ENST00000431915 425 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 EIF2B5-202ENST00000432569 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 BBOX1-AS1-204ENST00000531363 745 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC103810.4-201ENST00000578601 257 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC092687.3-201ENST00000606907 393 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC241585.2-202ENST00000621798 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC138430.2-201ENST00000624068 504 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC002511.3-201ENST00000638098 420 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GLI3P10071 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 SLC26A5-203ENST00000354356 2686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GLI3P10071 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms