Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLKQ9UBT6 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms