Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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RNF7Q9UBF6 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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RNF7Q9UBF6 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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RNF7Q9UBF6 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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RNF7Q9UBF6 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RNF7Q9UBF6 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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