Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSMD1Q99460 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms