Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBXN4Q92575 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms