Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF397Q8NF99 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms