Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC6Q8IVU3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms