Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APTXQ7Z2E3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms