Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC80Q76M96 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms