Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

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Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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H3F3CQ6NXT2 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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H3F3CQ6NXT2 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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H3F3CQ6NXT2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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H3F3CQ6NXT2 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H3F3CQ6NXT2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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