Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC102BQ68D86 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms