Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXD4L6Q3SYB3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms