Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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