Protein–RNA interactions for Protein: Q13480

GAB1, GRB2-associated-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAB1Q13480 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GAB1Q13480 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms