Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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KIF5AQ12840 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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KIF5AQ12840 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIF5AQ12840 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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