Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID5AQ03989 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms