Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZBED6P86452 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms