Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBB4BP68371 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB4BP68371 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB4BP68371 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB4BP68371 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB4BP68371 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB4BP68371 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB4BP68371 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB4BP68371 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TUBB4BP68371 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB4BP68371 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms