Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TPTEP56180 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TPTEP56180 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TPTEP56180 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms