Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HADHBP55084 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HADHBP55084 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HADHBP55084 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HADHBP55084 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HADHBP55084 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HADHBP55084 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HADHBP55084 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HADHBP55084 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HADHBP55084 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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