Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 GMEB1-201ENST00000294409 1912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 SMIM14-205ENST00000511809 830 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 AC105424.1-201ENST00000514583 209 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 AC044802.2-201ENST00000551187 434 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 TEX38-204ENST00000564373 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCA4P51532 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 GSTM2P1-201ENST00000405166 654 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AC114781.1-201ENST00000450559 1028 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 RN7SL2-201ENST00000490232 300 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 RN7SL4P-201ENST00000584058 295 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AC073254.1-209ENST00000604677 631 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 FKBP4P1-201ENST00000507284 1347 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 MRPL55-210ENST00000366736 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AC136475.9-201ENST00000605240 497 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 SKAP1-208ENST00000584924 1477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 TUBB8P9-201ENST00000422534 1276 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 TUBB8P10-201ENST00000430210 1279 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AKR1C6P-201ENST00000432950 983 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AC010677.1-201ENST00000441690 412 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AC025822.1-201ENST00000455525 633 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.47-201ENST00000616942 279 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 VPS33A-202ENST00000451053 1154 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AC004923.1-201ENST00000527543 776 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 INCA1-202ENST00000574617 1260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 AL109983.1-201ENST00000603234 646 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA4P51532 ZCCHC9-203ENST00000407610 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms