Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 AC010618.2-201ENST00000596192 460 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSEN2P49810 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 AC090515.5-201ENST00000560378 526 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN2P49810 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms