Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP4P49662 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP4P49662 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms