Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIP4K2AP48426 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms