Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
APOBEC1P41238 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms