Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA13P31271 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms