Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJB2P29033 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJB2P29033 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GJB2P29033 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms